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q收集样本时需要特别注意哪几点?
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一致性,也就是尽可能地保证采集样本的条件相同(时间、光照、数量、比例、环境等、容器)。淬灭,采集好样本后尽可能迅速地进行淬灭,常用淬灭方式有:液氮速冻、-40℃冷甲醇处理。量要尽可能多,以满足后继验证、其他组学等实验的需求。
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q样本有不同的批次,能否分批检测?
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不建议这么来做哦,因为批间差会远远大于组间差,因为质谱是精密仪器,每个时间段都是有波动的,一个月前测的结果和一个月后测的结果都是有一定差异的,如果咱们两批样本要放在一起分析的话,建议是等样本完全收集齐了之后一起检测。
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q血浆样本取完样来不及马上处理,对代谢组有没有影响?
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建议常温下放置1个小时以内进行离心。冰袋上放置2个小时以内进行离心,-80保存。时间越短越好。
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q样本收集时,样本类型的建议?
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一般来说,病灶部位的样本优先级最高,如果是动物实验的话最好是能直接取到相应部位,但是临床样本的话这类样本很难取,我们没法取正常人的组织,所以做肿瘤的话,可以选择癌组织和癌旁,如果是别的方向没法取到组织类的样本,可以考虑血清或者血浆这类周身循环的样本,然后是尿液和粪便,当然,样本的选择还是要根据具体研究方向来。
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q参考样本量太大,无法提供,怎么办?
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给出的参考样本量是我们经过大量项目和样本的验证得到的最佳取样量,样本量过少可能会导致实验结果不好甚至实验无法进行的风险,如果您实在没办法取到这么多的话,我跟技术反馈一下,看看有没有办法解决。
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q数据导入SIMCA后看到三个组在PCA上区分不开,但是两两分析的时候OPLS-DA的Q2和R2都>0.5,还可以继续往下分析吗?
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OPLS-DA后的数据有没有价值进一步往下分析,可以根据置换检验的结果,若置换检验后的结果较好,两条拟合线的斜率均大于0则可以尝试进一步分析。