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三代全长微生物多样性测序(16S/ITS/18S)


产品介绍

三代微生物多样性是基于PacBio测序平台,利用单分子实时测序的方法,对原核生物16S的全部V1-V9可变区域或真核生物的18S高变区域或ITS区域进行全长扩增,不仅能提高物种鉴定的分辨率,还能提高样本中微生物组成鉴定的精确度,从而更全面的反映微生物的群落结构




技术优势

◉  准确率高:基于HIFI模式对单一片段进行多轮测序,提升碱基准确性

◉  鉴定准确:全长序列携带信息更多,种水平物种注释率高

◉  长读长测序,避免短读长扩增子因扩增效率造成的序列丢失,更准确的还原微生物群落




样本要求

土壤/淤泥/沉积物等

≥2 g

粪便/肠道内容物

≥2 g

小鼠粪便

≥3

唾液/痰液

≥5 mL

拭子类

≥5 个

瘤胃液/发酵液

10mL 离心得到的沉淀

酒醅酒糟

≥2 g




检测平台


pacbio revio.png

PacBio Revio



应用方向

◉  临床医学与健康管理:人体肠道、口腔等部位微生物多样性与疾病的关联

◉  动物领域:肠道、瘤胃(如产甲烷菌类群)与动物健康/营养消化研究等

◉  农业领域:根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落研究等

◉  环境领域:雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境研究等

◉  食品工业与安全:监测食品加工储存过程中的菌群变化,快速识别食源性致病菌。




案例应用

1.Glycoursodeoxycholic acid regulates bile acids level and alters gut microbiota and glycolipid metabolism to attenuate diabetes.2023.Gut Microbes.【IF=12.2】

2.Disturbed Gut-Liver axis indicating oral exposure to polystyrene microplastic potentially increases the risk of insulin resistance.2022.Environment International.【IF=9.7】



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