蛋白质泛素化(Ubiquitination)是蛋白质在一系列特殊酶的作用下,被泛素(ubiquitin, 76个氨基酸组成的多肽)共价修饰的过程,泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物80%~90%蛋白质的降解,在几乎所有的真核细胞活动中起着关键作用,是一种重要的翻译后修饰。
- 泛素-蛋白酶体降解通路参与的各类生理过程研究
- 泛素-蛋白酶体降解通路调控异常引起疾病的发生等研究
▶ 细胞周期(Cell cycle progression),细胞凋亡(Apoptosis)
▶ 转录调控(Transcriptional regulation), DNA修复(DNA repair)
▶ 免疫应答(Immune response)
▶ 泛素蛋白经活化后特异性连接到底物蛋白上
▶ 底物蛋白被蛋白酶体降解
▶ 泛素蛋白回收利用
泛素化过程
CST泛素化肽富集抗体:Ubiquitin Remnant Motif (K-ε-GG) Kit #14482
▶ 产品类型
泛素化修饰蛋白组学
▶ 仪器平台
Orbitrap 系列, Thermo/Tims TOF Pro2, Bruker
▶ 搜库软件
Proteome Discoverer / MaxQuant
▶ 样本要求
细胞、微生物:1×108 cells/sample
血清、血浆:1.5 mL/sample
动物及临床组织标本:2 g/sample
植物嫩叶、嫩芽:10 g/sample
植物种子、果实:20 g/sample
液氮或-80°C保存
足量干冰运输,避免反复冻融
▶ Integrative proteomics reveals an increase in non-degradative ubiquitylation in activated CD4+ T cells
期刊: Nat Immunol
影响因子: 23.53
技术方法: 泛素化修饰定量蛋白组、蛋白组、转录组
▶ 研究内容
越来越多的证据表明泛素化可以直接导致非降解性的结果,但大多数关于T细胞泛素化的研究都集中在降解上。本文作者通过整合小鼠原代CD4+T细胞的蛋白质组和转录组数据,建立一个框架来预测泛素化引起的降解性或非降解性结果。二甘氨酸残基分析用于揭示泛素化的蛋白质,结合全细胞蛋白质组和转录组数据可以预测蛋白质的降解。通过二甘氨酸残基法鉴定泛素化蛋白的分析表明,CD4+T细胞的激活导致非降解性泛素化的增加。这与非蛋白酶体靶向的K29、K33和K63多泛素链的增加有关。本项研究揭示了1,200多种蛋白质在小鼠原代CD4+T细胞中泛素化,并强调了非蛋白酶体靶向泛素链在T细胞信号转导中的相关性。
▶ 技术路线
▶ 实验结果
▶ Central Role of Ubiquitination in Wheat Response to CWMV Infection
期刊: Viruses
影响因子: 5.818
技术方法: 泛素化修饰蛋白质组学
▶ 研究内容
泛素化是一种重要的翻译后修饰(Post‐translationmodification, PTM)类型,几乎参与了所有真核生物的生物学过程,在植物对病原体侵染的反应中起着至关重要的作用。然而,迄今为止,很少有大规模分析病原体(特别是病毒)诱导的小麦泛素化修饰的实例。该研究结合质谱分析鉴定了参与CWMV感染的泛素化蛋白,利用生物信息学进一步分析了这些泛素化蛋白的潜在生物学功能。
在感染CWMV的小麦植株中,共鉴定出1255个泛素化蛋白,2297个赖氨酸泛素化位点,其中192个蛋白质中350个赖氨酸泛素化位点存在表达差异。这些差异蛋白质在胁迫和激素、植物-病原体相互作用等代谢途径中进一步富集。此外,在CWMV感染过程中,先天性免疫系统的关键Ta14-3-3和TaHSP90显著增强,表明泛素化修饰在CWMV感染的调控网络中起着至关重要的作用。
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▶ 实验结果
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