产品简介
普通代谢组学可以反映机体代谢物的变化及可能被激活的通路,同一代谢物可能参与多条代谢通路,但其总含量不发生变化。代谢网络是复杂并且动态变化的,而普通代谢组学仅能提供静态的代谢物丰度信息,因此仍存在局限性,代谢流分析(Metabolic Flux Analysis,MFA)技术则可以很好地弥补这一局限。稳定同位素标记的代谢流分析技术更能体现细胞代谢网络的动态变化,反映遗传或环境因素扰动下的代谢重编程规律。通过在培养液中添加特定标记的底物,将13C或15N标记引入生物系统,随着细胞的生长,底物被吸收并代谢生成不同的代谢物,检测样本中被13C或15N标记上的代谢物,就可以反应细胞的代谢过程。
BIOTREE建立了基于LC-MS/MS平台的非靶标代谢流检测分析方法,不局限于特定的代谢通路,可对临床、动、植物样本进行全面地研究代谢流量随时间变化的动态规律,对流经代谢途径的代谢流量进行定量分析,能够很好的解释代谢物在代谢途径中的变化,将代谢组学的研究提升到更高的水平和层次。
Wang, R., Yin, Y., Li, J. et al. Global stable-isotope tracing metabolomics reveals system-wide metabolic alternations in aging Drosophila. Nat Commun 13, 3518 (2022).
技术优势
准:对齐国际MSI 标准,level 1鉴定准确率高达98%
严:非靶标代谢流不限于特定的代谢通路,可对标记的代谢物进行流向分析
全:1w+ BiotreeDB V3.0标准品数据库和专属数据库(临床/植物/脂质专业自建数据库)
多:高检出,level 1平均检出800+
广:追踪覆盖范围高,能够对上千个代谢物同时进行稳定同位素标记的追踪
优:仪器高灵敏、高分辨率,性能稳定
技术路线
技术参数
▶ 样本要求
血清、血浆:200 μL/sample
尿液:200 μL/sample
组织:200 mg/sample
粪便、肠道内容物:200 mg/sample
细胞 、微生物 :1×107 cells/sample
培养液 :200 μL/sample
因组织特异性,某些组织可能检测不到稳定同位素标记的信号。
▶ 生物学重复
样本数量: 植物和微生物n≥6,动物样本n≥10,临床样本n≥30,所有重复样本独立分析
其他种类的样品在收集之前请联系公司销售工程师
▶ 检测平台
Q Exactive Focus, Thermo/ Orbitrap Exploris 120, Thermo
▶ 常规项目周期
实验检测:25个自然日(从收到客户预付款并收到样品之日起)
数据分析:5个自然日
技术优势
▶ 同位素标记的代谢物丰度信息映射到KEGG通路中
将推荐注释代谢物映射到KEGG通路图中(图C),不同颜色代表代谢物对应的峰的含量信息或峰的同位素体分布比例信息,可以发现同一代谢物参与多条代谢通路的活跃程度。无偏向性的检测同位素体在生物体内的全部传递情况。
▶ 深度挖掘未知代谢通路信息
将推荐注释代谢物映射到KEGG反应网络中(图E),节点间的连线可以点击查看反应细节(图F),深度挖掘代谢反应,根据个性化的课题设计,发现现有代谢途径未被发现的新的功能性信息。
应用方向
非靶标代谢流分析可以广泛应用于生命科学和医药研究中,包括细胞代谢调控、代谢新通路、疾病代谢机制、药物新靶标发现与确证、药物药效及毒性评价、疾病诊断或预后生物标志物、药物代谢组学、精准用药等领域。
基因工程:提高基因工程菌目标代谢产物;基因改造前后的代谢功能变化
疾病机理:揭示肿瘤代谢抑制剂个性化治疗机制;疾病发生发展过程早期诊断的标志物
代谢重编程:炎症性巨噬细胞免疫代谢重编程机制;植物叶绿体代谢重编程机制