微量蛋白质组学利用高灵敏度的分析仪器、特定的样品预处理方法以及新兴的蛋白质富集技术,能够在样品量有限的情况下检测和鉴定蛋白质。可以从微量样品中制备出具稳健性、高通量、高产率和高重复性的蛋白质组学样本,有效助力后续的研究。
▶ 产品类型
微量蛋白质组学
▶ 仪器平台
timsTOF Pro2, Bruker
▶ 搜库软件
MaxQuant/ Spectronaut/ SpectroMine /
▶ 样本要求
动物组织标本:≥1 mg/sample
细胞、微生物:≥1×104 cells/sample
所需蛋白量:≥1 μg
液氮或-80°C保存
足量干冰运输,避免反复冻融
▶ 低样本量
检测所需蛋白量低至1μg,细胞量低至104个;
▶ 蛋白肽段一步提取
深度优化蛋白肽段前处理方法,蛋白肽段得率提升至高达90%;
▶ 高灵敏度的分析仪器
搭载4D质谱timsTOF Pro2,蛋白检出数量高达7000+(20μg蛋白)。
▶ Single-nephron proteomes connect morphology and function in proteinuric kidney disease
期刊: KIDNEY INTERNATIONAL
影响因子: 19.6
技术方法: 微量蛋白质组学
▶ 研究内容
肾小球性疾病是一种严重的肾脏疾病,导致肾小球功能受损并出现蛋白尿,并且目前尚无特异性治疗方法。本研究采用微量蛋白质组学,对于小鼠和人类肾脏的肾小球蛋白进行了表征,发现了与肾小球损伤相关的蛋白表达模块,包括细胞外基质蛋白沉积、肾小球白蛋白和溶酶体蛋白。此外,通过基因缺失实验,证实了LAMP1相关的溶酶体蛋白酶对肾小球损伤的影响。
基于4D的血清蛋白质组学分析
▶ Getting Ready for Large-Scale Proteomics in Crop Plants
期刊: Nutrients
影响因子: 5.9
技术方法: 微量蛋白质组学
▶ 研究内容
与细菌或动物相比,植物细胞蛋白含量比较低,且细胞壁和液泡含有大量影响蛋白质样品制备的物质,包括酚类化合物、水解氧化酶、萜类化合物、色素等。本研究使用微量蛋白质组学的样品制备方法结合LC-MS/MS的蛋白质组学分析方案,报告了一种适用于植物蛋白质组学分析的方法,并在番茄果实中进行了验证,证明了该方法的稳健性,为未来大规模绘制作物组织的蛋白质组图谱提供了方法。
植物蛋白质组学分析工作流程示意图