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q对于临床样本,寻找生物标志物时个体差异太大了,如何挑选样本?
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代谢组学首先要控制样本质量,性别、年龄、收集疾病用的正常对照要在同一家医院、如果多中心的(各个中心都要收集对照)这些可控的因素要控制好,后续虽然也有矫正方案,但不如开始的时候就考虑进去为好。
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q保存了1年的样本,还可以用来做组学检测吗?
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样本没有反复冻融过,没有受到污染,保存一年的样本也是可以用于做代谢组和蛋白组检测的。
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q外泌体样本的送样要求?
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咱们对外泌体是有要求是1*10^10 个外泌体/sample。您收集好样本后,可以从透射电镜粒径及浓度 WB检测三个方面对样本进行质量检测,合格后就可以送样来了呢~
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q哪些样本做蛋白质组学需要去高丰度?
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血清、血浆以及脑脊液,高丰度蛋白含量达99%,不去除的话,定性物质数量会少40%左右。
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q收集样本时需要特别注意哪几点?
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一致性,也就是尽可能地保证采集样本的条件相同(时间、光照、数量、比例、环境等、容器)。淬灭,采集好样本后尽可能迅速地进行淬灭,常用淬灭方式有:液氮速冻、-40℃冷甲醇处理。量要尽可能多,以满足后继验证、其他组学等实验的需求。
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q样本有不同的批次,能否分批检测?
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不建议这么来做哦,因为批间差会远远大于组间差,因为质谱是精密仪器,每个时间段都是有波动的,一个月前测的结果和一个月后测的结果都是有一定差异的,如果咱们两批样本要放在一起分析的话,建议是等样本完全收集齐了之后一起检测。
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q血浆样本取完样来不及马上处理,对代谢组有没有影响?
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建议常温下放置1个小时以内进行离心。冰袋上放置2个小时以内进行离心,-80保存。时间越短越好。