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q想用血液做非靶标代谢组,用血浆还是血清好一些?
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对于生物学研究而言,两种类型样本都可以用于代谢组检测去研究发病机制,筛选生物标记物等,没有差别。至于选择哪一下,根据个人实际情况做选择,比如血清有凝血过程,这个过程就会有代谢反应,而血浆需要加抗凝剂,有抗凝剂干扰。根据实际检测的项目经验,血浆内检测到的代谢物种类大约是血清的两倍。
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q动物组织样本很少,能测代谢组吗?
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动物组织样本建议提供200mg/例,我们一次上机需要的最低量是50mg,低于50mg可以尝试检测,但是检测效果会有折扣,物质数量会少一些,有些低丰度物质可能不会被检出。
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q临床样本需要设置多少个生物学重复?
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临床样本建议每组设置30例以上重复,条件允许,建议100例以上,越多越好。
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q对于临床样本,寻找生物标志物时个体差异太大了,如何挑选样本?
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代谢组学首先要控制样本质量,性别、年龄、收集疾病用的正常对照要在同一家医院、如果多中心的(各个中心都要收集对照)这些可控的因素要控制好,后续虽然也有矫正方案,但不如开始的时候就考虑进去为好。
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q保存了1年的样本,还可以用来做组学检测吗?
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样本没有反复冻融过,没有受到污染,保存一年的样本也是可以用于做代谢组和蛋白组检测的。
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q外泌体样本的送样要求?
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咱们对外泌体是有要求是1*10^10 个外泌体/sample。您收集好样本后,可以从透射电镜粒径及浓度 WB检测三个方面对样本进行质量检测,合格后就可以送样来了呢~
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q哪些样本做蛋白质组学需要去高丰度?
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血清、血浆以及脑脊液,高丰度蛋白含量达99%,不去除的话,定性物质数量会少40%左右。