非标(Label free)蛋白质组定量技术是一种不依赖于同位素标记的蛋白质定量技术,该技术通过液质联用对蛋白质酶解肽段进行检测,分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,对被检测到的离子峰强度进行积分,以积分面积进行相对定量。4D-Label free是基于timsTOF Pro2质谱平台检测的非标记定量蛋白组学技术,在传统三维数据(保留时间、质荷比、离子强度)的基础上增加了第四个维度,离子淌度的信息。与传统Label free相比,4D-Lable free的离子利用率和准确度更高,能以更少的上样量,实现高灵敏度、高通量、高精确度的蛋白检测。
▶ 产品类型
4D-Label free定量蛋白质组
▶ 仪器平台
timsTOF Pro2, Bruker
▶ 搜库软件
SpectroMine
▶ 样本要求
动物组织标本:50 mg/sample
血清、血浆:200 μL/sample
细胞、微生物:1×107 cells/sample
植物嫩叶、嫩芽:200 mg/sample
植物种子、果实:500 mg/sample
液氮或-80°C保存
足量干冰运输,避免反复冻融
- 食品科学领域:提高食品安全,改善口感和营养程度的研究
- 畜牧业领域:提高肉类品质和饲养条件
- 病毒领域:新型病毒抑制因子挖掘研究
- 农业领域:农作物发育机制的研究
- 生物疾病分子机制研究
- 生物疾病标志物研究
- 药物作用靶点研究
- 药物作用机理研究
▶ 扫描速度快:
在整个LC-MS/MS流程中,每秒可以获得100-150张高分辨的MS/MS谱,且可保持40,000-50,000高的分辨率;尤其适用于临床大队列样本分析,周期快。
▶ 高准确性:
额外一维离子淌度提高了数据完整性,可以从复杂数据库实现化合物的高可信度匹配以及更低的错误发现率(FDRs);
▶ 高灵敏度:
高扫描速度获得更高的灵敏度,可以使用更少的样品鉴定到更低丰度的蛋白;
▶ 高稳定性:
可以连续分析数千个样品,仪器保持稳定的性能。
▶ Metformin suppresses vascular smooth muscle cell senescence by promoting autophagic flux
期刊: Journal of Advanced Research
影响因子: 12.822
技术方法: 4D-Label free定量蛋白质组学
▶ 研究内容
血管系统中的血管平滑肌细胞(VSMC)衰老会导致血管衰老以及与年龄相关的疾病,二甲双胍可以通过增强自噬改善与衰老相关的炎症,但关于VSMC与二甲双胍之间的联系尚不清晰。文章假设二甲双胍可以通过恢复VSMCs和血管组织中的自噬活性发挥抗衰老作用,进而利用4D-Label free定量蛋白质组学探究二甲双胍的潜在作用机制。研究结果表明二甲双胍可以减少VSMC中衰老相关分泌因子的积累,预防VSMC的衰老和血管系统的老化,证明了二甲双胍作为预防血管老化的候选药物的潜力。
▶ 研究成果
功能富集分析显示二甲双胍抗衰老机制与自噬过程密切相关
▶ Metabolomics and Proteomics Characterizing Hepatic Reactions to Dietary Linseed Oil in Duck
期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
影响因子: 6.208
技术方法: 4D-Label free定量蛋白质组学
▶ 研究内容
多不饱和脂肪酸(PUFA)在许多富脂类食品中含量丰富,因对人体具重要生理功能而广泛关注,开发富含n-3 PUFA的家禽产品对优化脂肪酸组成具有重要意义。本研究以润州白冠鸭为研究对象,通过4D-Label free定量蛋白质组学和代谢组学评价补充亚麻籽油对血浆生化参数、肝脏显微结构、肝脏代谢组和蛋白质组的影响。研究拓展了对PUFA代谢过程产物的认识,并为肝脏健康提供了一些潜在的生物标志物。
▶ 研究成果
膳食亚麻籽油影响肝脏蛋白质组成