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BIOTREE第18期代谢组学暨多元变量统计分析培训班圆满结束!

代谢组学


7月22日,BIOTREE第18期代谢组学暨多元变量统计分析培训班在百趣生物总部所在地上海焦点梦想园拉开序幕,以专业的代谢组学培训,助力全国代谢组学领域的老师和同学们。

 

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恶劣的台风天气丝毫没有阻挡老师和同学们的学习热情。来自全国各地的近百名代谢组学研究领域的老师和同学们相聚一堂学习、交流、总结、提升,共同参与了一场干货满满、深入浅出的代谢组学专业培训。 

会议伊始,上海百趣生物医学科技有限公司CEO邓军亮老师作开班致辞。他首先给到场的各位嘉宾、老师和同学们介绍了培训班的情况、百趣生物六年发展的大事记,感谢大家对百趣生物的长期信任和支持。 


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其次,他重点介绍了百趣生物近期的突破性成果:BIOTREE云服务系统MAPS首发,它包含代谢物数据库2W多个,为代谢组学全流程(从样本处理到实验操作以及后续的数据分析)提供一个整体的解决方案;BIOTREE和南京扬子科创中心将共同打造一个全球顶级的质谱检测中心,希望给大家提供高质量、高性价比、高通量的检测服务。

再次,他希望大家能够在代谢组学领域大展拳脚,百趣即将推出针对培训班的奖学金计划也将助大家一臂之力,希望大家学有所成,得有所用,用有所成。 

最后,邓老师借乔布斯的一句话与大家共勉:Stay hungry, Stay foolish! 

7月23日下午17:30,本期代谢组学暨多元变量统计分析培训班(7.22-23日)已圆满落幕,下面让我们一起回顾一下此次培训班的精彩瞬间吧~

嘉宾:阿基业老师

中国药科大学研究员、博导

曾在江苏省人民医院临床药理研究室从事临床药学、瑞典Umea大学和英国伦敦大学从事代谢组学工作。现从事药物代谢动力学、代谢组学、药物毒性/药效的分子机理研究和评价、代谢性疾病发病机理等方向的研究。在代谢组学研究领域相关杂志发表论文29篇,其中以第一或通讯作者发表SCI论文18篇,累计影响因子60.8,申请专利六项。


代谢组学


报告主题:代谢组学基础及医药学应用研究


阿基业老师表示非常高兴来到上海和大家分享代谢组学研究的进展情况。他结合自己的研究经历给到场的老师和同学们讲解了代谢组学研究内容与对象及面临的多重挑战、样本的选择与处理、分析仪器、数据处理及分析、医药学研究应用等内容。阿基业老师在讲解过程通过生动形象的研究案例,娓娓道来,使在场老师和同学们醍醐灌顶,深表赞同。


嘉宾:纪剑老师


江南大学副研究员

当前主要研究方向为食品安全与代谢毒理、质谱代谢组学、真菌毒素联合毒性。迄今为止已在国内外重要学术刊物发表研究论文30余篇,其中第一作者SCI论文12篇,包括Biosensors & Bioelectronics,Scientific Reports等,H指数14,引用次数427次,第一作者IF总和>34。

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报告主题:GC平台数据预处理

纪剑老师简单介绍了基于GC-MS代谢组学的技术、数据分析的流程,并重点解析了GC-MS数据预处理,获得高质量数据导入SIMCA软件中的方法。纪老师细致、耐心的讲解让现场的学员们收获颇丰。



嘉宾:陶用珍老师

中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所副研究员

2013年加入尹慧勇课题组担任担任副研究员。主要从事于人类重大疾病如癌症、糖尿病等营养代谢以及关键代谢信号通路的研究,基于GC-MS和NMR的代谢组学平台,并结合C13稳定同位素示踪法和代谢流量组学等方法,以期找到新的致癌基因或者引起人类重大疾病的代谢途径及药物治疗靶点。

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报告题目:C13-代谢流在人类代谢性疾病中的应用

陶用珍老师主要讲解了三个部分的内容,分别是:C13或者N15的代谢流量的定义、原理及其样品制备;如何设计特殊的标记物监测胞内外的代谢流量的变化;C13或N15代谢流量分析在人类重大疾病中的应用。陶老师深入细致、形象生动的授课让现场的老师和同学们对代谢流方面的研究有了更清晰、更深刻的认识。


嘉宾:涂嘉老师

上海有机化学研究所博士

中国科学院上海有机化学研究所朱正江课题组博士。研究方向为:1.发展基于质谱技术的脂质组学的方法开发,包括数据采集、数据库建立、数据分析等;2.运用脂质组方法研究衰老、神经退行性疾病等。目前在Current Opinion in Chemical Biology, Analytical Chemistry, Metabolomics期刊以第一作者及参与者身份已发表五篇论文,一篇共同第一作者身份Nature投稿中。

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报告主题:Mass Spectrometry(MS) based Lipidomics

涂嘉老师从Introduction to lipidomics、MS based lipidomics workflow(Sample preparation-Data acquisition-Data processing-Data interpretation ) 、Case analysis三个方面对脂质组学研究进行了精彩的讲解,让各位学员对脂质组学研究有了清晰明了的认识,深入了解了脂质组学研究的方法及过程。



嘉宾:吴洪强老师

BIOTREE 技术总监

毕业于中国科学院上海生命科学研究院,主要研究方向:疾病诊断产品开发与应用。知识产权:先后申请了11项发明专利,8项实用新型专利,2项软著,1项高新技术成果转化立项。2012年参与创办阿趣生物。

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报告主题:

1.代谢组学GC-MS技术平台

2.Metabolomics Analysis Platforme Solution

吴洪强老师不仅详细地讲解了代谢组学GC-MS技术平台的硬件、软件、应用及其经典案例,还隆重介绍了BIOTREE云服务系统MAPS。让学员们不但明白了各种GC-MS技术平台的特点、区别及适用情况;常用的数据处理方法和数据库;实验流程及技术特点,还详细地了解了MAPS系统的强大功能和便捷的使用方法。



嘉宾:何敬全老师

博士、BIOTREE健康研究院院长

北京大学理学博士,美国德克萨斯大学休斯顿健康科学中心博士后。目前研究方向: 利用质谱代谢组学手段,从小分子代谢物水平对疾病进行研究。 主要包括以下方面: 1.与高校、医院、研究所合作研究及发表高水平科研论文; 2.开发新的质谱方法,服务于临床疾病诊断以及血药浓度检测; 3.通过对疾病代谢组进行研究,开发临床应用产品。

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报告主题:代谢组学实验设计与SCI论文撰写

何敬全老师详细地讲解了什么是代谢组学;代谢组学研究和其它组学研究的区别;代谢组学研究的整体思路及实验设计各环节的实施方法;SCI论文各部分如何撰写,最后何院长还和大家分享了写好SCI论文的一些心得体会,其中比较重要的一点就是: learn from other papers。


嘉宾:刘国强老师


赛默飞高级应用工程师

北京大学药学院生药学专业,10年液质联用经验。擅长液质联用技术在中药成分的分析、药物代谢物鉴定、代谢组学等领域的应用与方法开发工作。

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报告主题:常用的LC-MS仪器平台在代谢组学研究中的应用

刘国强老师介绍了质谱技术在代谢组学研究中的应用、部分仪器厂商的三重四级杆质谱平台、部分仪器厂商高分辨质谱平台、基于Orbitrap的高分辨液质系统、代谢组学研究进展、LC/MS仪器平台在代谢组学研究中的应用等内容,让现场的学员们对代谢组学研究中的检测仪器的选择和运用有了清晰明了的认识。


嘉宾:杜杰老师


BIOTREE生物信息主管

参与国内近百家科研单位代谢组学和蛋白组学平台,协助客户发表文章20多篇,累积影响因子高达50,其中高影响因子5篇。专注于代谢组学和蛋白组学科研领域,擅长组学间数据关联分析、统计建模和生物学意义信息挖掘,在临床、医药、发酵等科研方向有多年的项目实战经验。

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报告主题:

1.由数据到成果——多元变量统计分析策略简析

2.SIMCA软件(案例)实操及答疑

杜杰老师从大数据与多元变量的重要性、SIMCA 15、使用SIMCA进行组学数据分析、SIMCA的其他应用、Biotree-系统生物学解决方案、代谢组数据挖掘练习六个方面让学员们对多元变量统计分析策略的策略有了深入的了解,此外通过SIMCA实操环节学员们初步掌握了SIMCA软件的运用。


嘉宾:赵翠平老师


BIOTREE项目管理部主管


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报告主题:代谢组学研究中的样本采集和预处理

赵翠平老师结合自身多年的GC-MS平台的实践经验与到场的各位学员分享了样本收集的特点、常见样本的收集方法、各种类样子的处理方法及样本寄送方法及注意事项。


更多精彩瞬间回顾


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培训班现场总览


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参会学员与吴洪强老师沟通交流

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参会学员与阿基业老师沟通交流

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参会学员向老师请教问题

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参会学员现场提问

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培训班开班现场概况

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学员们分批参观百趣生物实验室

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学员们近距离了解LC-QQQ-MS

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学员们近距离了解QE

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学员们参观、了解GC-MS平台的仪器

同期课程:

2018.7.22 -23 代谢组学暨多元变量统计分析培训班(已结束)

2018.7.24-25  unknown 物质鉴定培训(已结束)

2018.7.26 -27  层次聚类热力图、Pathway实战及代谢通路网络构建分析(已结束)

2018.7.28 -29  MVDA for Research培训


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